El sorteo para formar los grupos en el futbol masculino y femenino fue realizado por el Comite Organizador de los Juegos y con presencia de representantes de la Federacion Costarricense de Futbol y UNCAF.
El 6 de marzo se inicia la actividad del futbol femenino en el estadio de Rohrmoser, mientras que el masculino arrancará el 7 de marzo. El futbol masculino y femenino de este certamen es clasificatorio a los Juegos Centroamericanos y del Caribe (2014).
Luego de realizado el sorteo los grupos quedaron conformados de la siguiente forma:
FUTBOL MASCULINO:
GRUPO I:
COSTA RICA
EL SALVADOR
NICARAGUA
BELICE
GRUPO II:
HONDURAS
GUATEMALA
PANAMA
FUTBOL FEMENINO:
GRUPO I:
COSTA RICA
EL SALVADOR
NICARAGUA
BELICE
GRUPO II:
GUATEMALA
HONDURAS
PANAMA